对付擅长水遁的干柿鬼鲛，宇智波千月使用了雷遁·麒麟，再开遁甲八门干掉他。
雷遁·麒麟，关于麒麟这个术：这个术的优点很明显，范围广，攻击力大，耗查克拉少（只是利用大自然的雷电）而且速度快得无法躲避。但是弱点也很明显，需要自然天气的帮助（当然，可以自己制造，但是需要很多次的火遁才可以，因此这里也很耗费查克拉），而且要看清楚雷电的速度和流向才行。麒麟这个术之所以被定义为S级难度的术，有相当大部分的难度都是在如何制造雷云这一方面上的。首先是佐助把鼬引到上面战斗，而两兄弟的战斗时用的忍术都是火遁，在不知不觉中火遁的热度影响了天空，还有佐助对着天空用了多次的豪龙火之术产生上升气流，然后上升气流又产生积雨云，最终积雨云可以产生雷击，而在引雷电的时候，佐助一直都是开着三勾玉写轮眼的，因为雷电的速度很快（只有千分之一秒比音速还要快），如果一不小心的话就会电到自己，最终才完成了这个术。而且自己本身也要远离被攻击者，否则会伤及自己（所以那时候佐助是在最高处的地方的，而鼬在佐助的下边）。
愤怒的神兽的咆哮惊天动地的一击从天而降！！
佐助所开发出的雷遁·麒麟，可以说是将雷属性发挥到极致，是雷遁忍术的终极奥义！在鼬佐之战中，佐助首先是用火遁·豪龙火之术令周围的空气急剧增温，从而产生上升的气流，上升的气流又产生积雨云，最终积雨云产生雷电。然后佐助把雷电进行形态变化，使其化成麒麟的形状并通过手中的千鸟引向敌人，瞬间将巨岩化成灰烬，敌人完全没有躲避的余地。在惊天的咆哮声中同时消灭敌人！
因为是利用自然力量的忍术，所以只要消耗小量的查克拉就可以发动，而且其威力也是极其巨大的！以忍者巅峰为目标的佐助，最终连大自然的雷电都可以控制在手上。雷遁·麒麟是目前攻击速度最快的雷遁忍术，比音速还快，只有千分之一秒！属于S级的雷遁忍术奥义。速度快、消耗查克拉少、威力更是强大雷遁·麒麟是一个非常实用的忍术也是一个很难控制的忍术。
在另一边，木叶村收到情报，得知大蛇丸被佐助所杀，便开始进行寻找佐助的任务，而“蛇”的成员香磷发现木叶的人在追踪佐助，“蛇”便到“晓”的根据地，而佐助更遇到鼬，鼬便指示佐助往宇智波一族的故地，来个了断。途中佐助先到故地南贺的神社大堂，并在那里的秘密集会场所，发现鼬所指的宇智波瞳术‘万花筒写轮眼’的存在目的--为了能够控制九尾的力量。亦得悉万花筒写轮眼的使用，最终是会招来失明的命运。
两兄弟甫决战，初时佐助似乎占了上风，从鼬背后向其插了一刀;但是这却又是鼬的分身，佐助立刻向身后的另一个鼬使用千鸟流攻击。后从绝口中才得知，双方似乎是在战斗，但其实只不过是幻术上的攻防战，实体一直未有动身。他从鼬口中得知宇智波一族创始人--宇智波斑仍存在的事实，就是斑跟鼬一起灭了全族。亦得知宇智波斑也同样拥有万花筒写轮眼，是第一个以眼睛控制九尾及揭露此眼另一秘密的人。鼬续向佐助说万花筒写轮眼的另一秘密，就是本已是万花筒写轮眼拥有者的人，能从其他族人中夺取同样的眼后而创造有独特力量的‘新双瞳’，而且永不会堕入黑暗的失明世界中。因此鼬一直以来要佐助练成万花筒写轮眼，正是要这个弟弟作为他的‘备用品’，以脱离万花筒写轮眼拥有者失明的命运。
佐助知道一切真相后，亦有所行动。虽然佐助巧妙利用飞镖攻击及以蛇身作掩护，但因与鼬间有一段实力差距，受鼬所制肘，并被鼬夺去了左眼。当然，实际上这些都只是鼬以‘月读’所制造出来的幻象，鼬本以为这样便可能使佐助的实体陷入麻痹当中。但想不到的是佐助却有能力破解他的‘月读’，反使鼬左眼受伤。佐助指出瞳术毕竟也只是工具，写轮眼也有可以超越万花筒写轮眼的力量。鼬的幻术失效，又有左眼受伤，故佐助乘胜使出擅长的‘影风车之术’，使鼬身体受创。后再以‘火遁·豪火球之术’攻击鼬，鼬亦以‘火遁·豪火球之术’还击，但被佐助压制下来。
此际鼬突然使出高级瞳术‘天照’，黑色的火焰把佐助的火焰吞噬下来，并一度欲把佐助也吞噬掉。佐助于是便巧妙地使出大蛇丸流的变身术，使真身穿入地底当中以避开‘天照’的吞噬;他又清楚鼬使出‘天照’之时是没法进行变身，也深知鼬的体力已到极限，故在地底中进入咒印状态2，并使出‘火遁·豪龙火之术’之术突击在地上、已受伤的鼬。鼬虽仍能避开，但右手却被烧伤，而之前的战斗亦使鼬满身伤痕，查克拉已用尽。佐助同样也在使出火遁之时已把查克拉耗尽，但为了杀鼬他已早有准备，将要使出最终的极秘忍术对鼬必杀……
原来佐助是透过火遁术射向天空以制造出雷电，并将巨大的雷电之力集中于手中并引向攻击鼬。这个被佐助名为‘雷遁·麒麟之术’，一举将鼬所身处的岩石击得粉碎，使得鼬直接崩溃倒地……但意想不到的是鼬却也使出终极防御，防御了佐助的轰击，鼬亦使出了他的终极之术‘须佐能乎’，原作防卫的骷髅慢慢化成巨人。就在这时查克拉已尽枯竭的佐助不顾一切凝聚查克拉导致被平时被压制的大蛇丸出现，大蛇丸使出‘八歧之术’变化出八歧大蛇要夺取佐助身体。
八歧大蛇先后被‘须佐能乎’斩下头颅;而本来潜藏在八歧大蛇内的大蛇丸，被‘须佐能乎’的十拳剑(别名酒刈大刀，草剃剑的其中一把，能将所有刺中的东西封印在醉梦的游离世界内)刺中，连同八歧大蛇一起被吸进‘须佐能乎’所持的酒瓶内。面对鼬的‘须佐能乎’之术，佐助因查克拉已消耗完，无法使用写轮眼的力量了，唯有不断以引爆符进行攻击;但这却一一被‘须佐’所持的‘八咫镜’抵御过来，鼬更步步迫近。
但是鼬也身体全面崩溃，口吐大量鲜血，在佐助的额头前轻轻按了一下，在佐助耳边说了句密语（其实是说‘原谅我，佐助，这是最后一次了’），然后突然倒下。鼬躺在佐助旁边的地上，而佐助却一直呆站着。天降大雨，而天照之火仍不熄灭的燃烧…当佐助看见旁边的鼬再也不动后，笑了一笑也接着倒下……
对于宇智波鼬，宇智波千月不打算干掉他，而是说服他。宇智波鼬，属于火之国木叶忍者村宇智波一族，宇智波佐助的哥哥。年少时跟宇智波止水是挚友。族中的天才忍者，实力高超，擅长幻术。为了保护村子免受战乱，接受了木叶上层给予的将宇智波一族灭族的任务，之后加入晓做木叶的卧底。最终在与弟弟宇智波佐助的战斗中为佐助注入瞳力后，因身体患有不治之症体力不支而亡。第四次忍界大战中被药师兜秽土转生，在和漩涡鸣人与奇拉比的战斗中由于使用了万花筒写轮眼，触发了原本留给鸣人体内装有止水左眼的乌鸦并对鼬使用了别天神，进而使鼬摆脱秽土转生的操控，后与佐助合力制服药师兜，最终解除秽土转生，灵魂升天。
木叶九尾之乱中，5岁的鼬一个人在家保护还是婴儿的弟弟佐助。7岁从忍者学校毕业，鼬是宇智波一族与宇智波止水齐名的少年天才，两人也是挚友。第三次忍界大战，鼬年仅4岁就目睹了太多的死亡，对于这么小年纪就经历战争的他来说，战争简直就是地狱，这个创伤使鼬厌恶战乱，从此成为一个热爱和平的男人。7岁以全校第一的成绩从忍者学校毕业，三代目火影猿飞日斩评价过鼬7岁的时候就能像火影一样思考问题，8岁便开了写轮眼。10岁升为中忍，11岁加入暗部，受止水影响，从小的他就能超越狭隘的本族主义，尽心尽力为村子做事。在2014年9月出版的游戏《火影忍者究极风暴-变革》中特别介绍了止水和鼬的剧情。加入暗部后的他的能力更是得到了队长旗木卡卡西的肯定，在加入暗部后由于出色的才能不久便被“借调”到了志村团藏所在的暗部。加入暗部的他不但承担着宇智波一族与村子沟通的桥梁，更是作为木叶和宇智波的双重间谍而往来于两者之间。
木叶九尾之乱后高层怀疑操控这一变乱的人是宇智波族人（其实就是宇智波带土，但不是族人授意的），于是在志村团藏的建议下对宇智波地区进行24小时监控，本就因为二代目火影以建立木叶警务部队为由将宇智波一族隔离的木叶基本政策而不满的宇智波族人终于爆发了出来，企图在由宇智波鼬的父亲宇智波富岳领导的村子的政治斗争中夺取自己的地位。在危机爆发前宇智波止水面见三代目火影，打算在宇智波一族的集会上观察宇智波富岳的态度，如果政变无法阻止，就使用最强幻术-别天神改变他的想法从而阻止叛乱。但是志村团藏并不相信他，同时也是为了夺取他的万花筒写轮眼，所以偷袭止水成功，夺取了止水的右眼。
在失去右眼之后止水为了不让左眼再落入其手、维护宇智波之名，将左眼送给鼬，并嘱咐鼬要为了和平使用它、全力阻止宇智波政变，并且让鼬对他的事情保密，最终投南贺河自尽。宇智波鼬亲眼目睹止水自杀，并开启万花筒写轮眼，宇智波鼬使用万花筒写轮眼阅读了神社内六道仙人留下的只有万花筒写轮眼才能阅读的文字（文字分三种能力解读：写轮眼-万花筒写轮眼-轮回眼）。
由于止水自杀且宇智波鼬并没有参加那晚的集会，宇智波族人怀疑是宇智波鼬杀死了止水，被鼬断然否定（止水本被族人要求监视不被信任的宇智波鼬）
由于宇智波一族在与木叶的政治斗争中总受压制，一族人不甘心便在其父亲的带领下叛变木叶，鼬不得已成为双重间谍，时年13岁。之后他背负污名成为叛忍加入晓组织监视其内部动作。
止水自杀使得宇智波族人元气大伤，士气低落，但是族人仍然决意叛变。鼬面见木叶高层汇报了这一情况，在场的高层中只有三代目火影坚持想以谈判的方式解决宇智波政变，但因为事情已经来不及改变最后只说请鼬帮他争取一点时间，事实上除了歼灭宇智波全族之外已再无其他善法。
志村团藏之后找到了宇智波鼬，以鼬的弟弟宇智波佐助的性命作为交换让宇智波鼬诛灭全族并对佐助保密，自己以叛忍的身份搜集对木叶不利的组织情报。为了保护村子防止其他国家乘虚而入，也是为了止水的意愿和弟弟的性命。鼬在痛苦与煎熬中被迫接受了灭族任务。
政变当晚宇智波鼬和宇智波带土（之前鼬找到他答应帮他向宇智波一族复仇但不许他对村子出手）一起动手诛灭了全族，宇智波鼬含泪与父母道别，他们将佐助托付给了鼬，并给弟弟设定了一个向自己复仇这一目标之后逃离木叶，临走前威胁团藏如果敢伤害佐助就将村子情报出卖敌国。逃离之后根据带土的建议加入了他的组织-晓。
三代目火影默许了这个事实并答应鼬保护他的弟弟。
由于晓组织的命令，在大蛇丸叛变“晓”之后，与干柿鬼鲛搭档两人一组四处行动。鼬与鬼鲛负责捕捉九尾的任务，两度与鸣人、卡卡西等人交手。
在大蛇丸毁灭木叶计划中三代目火影使用尸鬼封尽而牺牲，宇智波鼬和鬼鲛以刺探木叶情报为由（其实是为了警告团藏不许对宇智波佐助出手）进入木叶村与旗木卡卡西等人第一次交战，并对卡卡西使用月读，使卡卡西受了严重的伤，并刺激盲目对自己报仇的佐助最终导致佐助叛逃出村投奔大蛇丸，之后使用天照逃出了自来也通灵的大蛤蟆的胃中。
在风影我爱罗被迪达拉和蝎抓走并封印一尾时为了拖延时间，鼬与卡卡西，漩涡鸣人等人再次交战，由于不是本体，不久便被鸣人等人击败。
鸣人在追踪佐助的途中遇到了宇智波鼬，宇智波鼬对鸣人施展幻术，在幻术中了解了鸣人带回佐助的决心，遂决定将后事托付给鸣人，同时将带有止水左眼的乌鸦放入了鸣人体内，准备一旦佐助杀死自己后堕落，企图对木叶进行报复时必会与鸣人交战，为了追求力量和永恒的万花筒，佐助一定会移植自己的万花筒写轮眼，到那个时候乌鸦就会出现，对佐助施展别天神·守护木叶，强行改变佐助的意志。
佐助杀死大蛇丸后成立了蛇小队目的是杀死宇智波鼬。在身患重病，身体濒临极限的情况下，鼬与佐助约战。三日后与佐助交战，在战斗中，鼬根本没有将佐助置于死地的想法，只是为了令佐助摆脱大蛇丸的咒印束缚而做戏要挖其双目，临死前他将佐助逼到了极限，在佐助的杀手锏-麒麟放出来后使用须佐能乎成功抵挡了忍术，之后佐助精疲力竭，体内的大蛇丸乘机侵占佐助的身体，这正中了鼬的下怀，遂用十拳剑将大蛇丸成功封印，之后用天照烧死了大蛇丸的白蛇（至此大蛇丸彻底死亡）。之后微笑着点了下弟弟的额头，并且请求佐助最后一次原谅他。他是为了向死在自己手中的宇智波族人赎罪和维护宇智波一族最后的名誉而选择背负一切死在佐助手中，生命的最后，鼬不仅在佐助的眼中设置了转写封印·天照来防范斑（宇智波带土）的不良居心，而且微笑着死在了佐助面前，让佐助达成了开启万花筒写轮眼的条件。
鼬死后，眼睛被追求力量的弟弟佐助移植而形成新的永恒万花筒写轮眼。
第四次忍界大战时期，鼬被药师兜用“秽土转生”重新召唤至人世，开战后和被秽土转生的长门一起行动。在战场上与鸣人相遇，借助之前交给鸣人的力量“守护木叶”脱离了秽土转生的控制，询问鸣人佐助的动态并安心地把佐助托付给鸣人，并且帮助鸣人和比封印了长门。他告诫鸣人：“并不是成为火影的人就会被大家所认可，而是被大家所认可的人才能成为火影。”
之后鼬决定亲自去阻止秽土转生，在路上与佐助相遇，被佐助问及关于自己的真相。后来鼬和佐助联手在洞穴中对抗兜，兄弟羁绊再现。
兜一直在挑拨佐助与鼬之间的关系，希望佐助站到自己这边来，鼬叫佐助不要听兜的，并说了最感人肺腑的一句话“不论村子有多么黑暗，有多少矛盾，我都是木叶的宇智波鼬”。
在战斗中，鼬向兜施展了与“伊邪那岐”一对的另一个究极瞳术——决定命运的“伊邪那美”，使兜陷入永恒轮回的命运之中，并利用幻术得知了解除秽土转生的结印方法，因而解除了秽土转生。在秽土转生即将解除之际，鼬对佐助说“不论你选择什么样的道路，我都一直深爱着你”，之后灵魂升天。
对于鼬来说，最重要的人便是宇智波佐助。
宇智波灭族时，他在月读的世界里欺骗佐助，把灭族说成是为了测试自己的器量，为的是给予佐助新的人生目标，让佐助不断地变强，以防木叶上层对其不利，而鼬自己却背负一切污名成为了木叶的叛忍。在佐助的回忆中，在鼬离开之时，佐助因为受到巨大刺激而开了一勾玉写轮眼，并在追逐中用苦无将鼬的护额打下，鼬拾起护额，重新戴上，然后佐助看到了，他的哥哥，宇智波鼬流下了痛苦的眼泪。随后佐助因受打击过大而昏迷在地，并且忘记了这一小段场景，鼬从此也就离开了木叶忍者村。
根据斑的描述，鼬在晓的时候常会回忆起村子还有他最爱的弟弟。
他用一生来维护忍者世界的和平，并为亲爱的弟弟佐助付出了一切。
宇智波鼬只有唯一的一个挚友-宇智波止水，两个人从小一起长大，惺惺相惜。鼬更是接受了宇智波止水的思想，为村子尽力，因为亲眼目睹了止水之死而开启万花筒写轮眼（开眼条件是目睹或杀死对自己最重要的人）。
在晓中鼬的搭档是干柿鬼鲛。两人第一次见面时鬼鲛曾问到鼬对杀害自己同胞的看法，鼬回答杀死同胞的人不得好死，只有在自己死的时候才能看到真正的自己。最后干柿鬼鲛临死时回想起鼬说的话，说道：我看到了真正的自己，鼬先生，你是否在死之前也看到了呢？之后鬼鲛死亡。
宇智波鼬代表的是日本神话中天照大御神的使者八咫鸦（在日本传说中三只脚的乌鸦，具有忠贞、勇敢、大无畏精神，同时也是中国古代传说中被后羿射日射下来的太阳神鸟），也可以是天照大御神本人！
鼬总是释放乌鸦幻术，并且分身也是使用的耗费查克拉少量的乌鸦分身。在日本神话中，现世的管理者是天照大御神，常世的管理者是月读命神，素盏鸣尊（须佐之男）曾凭十拳剑斩杀八岐大蛇，从其尾部抽出草薙剑。但是，须佐之男并没有八咫镜，八咫镜是天照大御神的。
宇智波鼬正是八咫鸦的化身，秽土转生归来扭转了战局，并且以自己的方式引导着第四次忍界大战走向胜利。
对于那个真相，宇智波鼬不能淡定了，在一番交手后没有成功干掉宇智波千月，因此他暂时选择了合作，正式成为联盟友。
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